Il dipartimento di biologia evoluzionistica sperimentale è diviso in due sedi (Via Selmi e Via Irnerio) e comprende al suo interno il Museo di Anatomia Comparata, di Antropologia, di Zoologia, l'Orto Botanico e l'Erbario, nonché il Laboratorio di Biologia Marina e Pesca di Fano che possiede un ricca biblioteca di libri e riviste di biologia ed ecologia marina ed oceanografia.
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